[1]仲兆平，杨建平、宋昕等，半干法-湿法耦合型垃圾焚烧尾气污染物超低排放技术创新及应用，教育部科技进步二等奖，2017。
[2]金保升，仲兆平，周长城等，燃煤烟气SCR脱硝关键技术研发与工程应用，江苏省科技进步一等奖，2014。
[3]王晓佳、仲兆平、安凤霞、张波、刘景亮，“廉价-高效”固体燃料化学链燃烧分离CO2机理研究，中华环保联合会自然科学二等奖，2022
[4]塔内氧化-钙基强碱-石膏湿法烟气脱硫装置，福建省科技进步一等奖，2013，排名第10。
[5]燃煤超低排放与湿烟气微细颗粒物控制技术及产业化，江苏省科学技术二等奖，2017，排名第6。
[6]彭代军、仲兆平、宋红兵等，大型燃煤电站SCR脱硝尿素热解制氨关键技术研究及产业化，北京市科技技术二等奖，2015。
[7]陈冠益、仲兆平等，造粒生物质燃烧及其污染控制技术与装置，国家环境保护科学技术奖二等奖，2015
[8]高热值有机固废高效清洁稳定焚烧技术装备研发及应用，江苏省科学技术三等奖，2023，排名第3。
[9]朱复东，仲兆平等，高效流态化滤泡法烟气脱硫装置，江苏省科技进步三等奖，2009.1。
[10]U型吸收区高速平流吸收塔集成式烟气脱硫技术，教育部技术发明二等奖，2009，排名第6。
[11] 杨亚平，仲兆平，金保升等，电站煤粉锅炉掺烧石油焦系统技术，江苏省科技进步二等奖，2004.12
[12] 金保升，秦建明，赵长遂，吴国庆，仲兆平等，节能环保型颗粒氧化铅移动床深度氧化和快速冷却生产新工艺，教育部科技进步二等奖，2005.1
[13]仲兆平，流态化洗涤吸收和管道喷射吸附联合型垃圾焚烧尾气净化基础研究，江苏省优秀博士学位论文奖，2005.8
[14]江苏省“333高层次人才培养工程” 中青年科学技术带头人，2007
[15]“新世纪优秀人才”，教育部，2005
[16]常州市人民政府奖教金，东南大学教育基金会，2010年
[17]许尚龙奖教金, 东南大学教育基金会, 2002年