13. 哈尔滨工业大学城市水资源与水环境国家重点实验室项目，非生物因子对浅水湖泊浮游群落健康的影响研究 (ES202413)，2024-2025，主持。
12. 南京大学污染控制与资源化研究国家重点实验室项目，基于污水流行病的太湖流域大环内酯类抗生素消费评估研究 (PCRRF21050)，2022-2023，主持。
11. 东南大学环境医学工程教育部重点实验室项目，基于深度学习的影响太湖生态健康关键因子识别 (2021EME001)，2021-2022，主持。
10. 南京大学横向课题，太湖抗生素浓度调查与数值模拟，2020-2021，主持。
9. 东南大学新进教师人才引进启动经费，2019-2020，主持。
8. 国家青年科学基金项目，太湖典型抗生素多介质环境行为及生态健康研究 (41601509)，2017-2019，主持。
7. 中央高校基本科研业务费专项基金，太湖蓝藻典型示范区生态系统结构稳定性的研究 (20620140481)，2014-2015，主持。
6. 国家水体污染控制与治理科技重大专项，基于太湖水生态变化监控系统平台进行太湖水生态辅助管理决策支持系统框架设计 (2012ZX07506-003)，2013-2016，子任务主持。
5. 国家水体污染控制与治理科技重大专项，太湖流域（江苏）主要水污染物累积性环境风险预警与溯源技术研究与示范 (2012ZX07506-004-004)，2013-2016，子课题主持。
4. 国家水体污染控制与治理科技重大专项，基于中俄界河和松花江出境水质的高环境风险源识别(2009ZX07207-008-5-2)， 2009-2011，课题骨干。
3. 国家高技术研究发展计划，松花江跨界重大环境污染事件风险防范与应急技术系统(2008AA06A411)， 2008-2011，课题骨干。
2. 城市水资源与水环境国家重点实验室基金，城市水系统中典型有毒物质环境暴露及复合污染 (2008DX01)，2008-2010，课题骨干。
1. 黑龙江省科技攻关重大项目，松花江流域特征污染物迁移转化规律研究(GA